NY/T 3640-2020 标准解读

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作者:标准下载站
发布时间:2026‑08‑13
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一、核心基础术语释义

  • SSR分子标记:指基于简单重复序列(Simple Sequence Repeat)的DNA分子标记技术,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增基因组中特定微卫星区域,利用长度多态性进行遗传分析。
  • 葡萄品种鉴定:通过分子生物学手段对葡萄(Vitis vinifera L.)栽培品种进行遗传特异性识别与分类的方法。
  • 多态性位点:基因组中存在两个或多个等位基因变异的物理位置,用于区分不同遗传材料。
  • 等位基因:同一基因位点的不同DNA序列变体,由单核苷酸差异或重复单元数目差异形成。

二、专项技术术语解析

  1. 核心引物对:标准中规定的必需检测的SSR位点配套引物组合,包含VVS2、VVMD5等12个高度多态性位点,用于构建品种DNA指纹图谱。
  2. 等位基因分型:通过电泳或毛细管电泳检测PCR产物长度,与分子量标准比对后确定目标位点的等位基因组合。
  3. 多态性信息含量(PIC):衡量标记位点遗传多样性的数值指标,计算公式为PIC=1-ΣPi²(Pi为第i个等位基因频率),值域0-1。
  4. 重复性验证:通过同一批次内样本重复检测(至少3次)确认实验体系稳定性,要求等位基因分型一致率≥98%。
  5. DNA指纹图谱:由核心引物对扩增结果整合形成的数字化遗传信息组合,每个品种具有唯一编码标识。

三、易混淆术语区分

术语对比SSR分子标记SNP标记
技术原理基于重复序列长度多态性基于单核苷酸位点变异
检测通量中低通量(10-30位点)高通量(成千上万位点)
数据分析显性/共显性标记分析二等位基因型分析
品种特异性与一致性区分:品种特异性指SSR标记可区分不同品种的能力,通过等位基因组合唯一性判定;一致性要求同品种内所有检测位点基因型完全一致。

四、术语应用规范

  • 文书表述规则
    1. 正式报告中须使用全称"简单重复序列",首次出现缩写SSR时加括号注明
    2. 位点名称按标准格式书写(如VVS2、VVMD5),斜体表示基因座
    3. 等位基因标注采用"位点名称+下划线+片段长度"格式(如VVS2_128)
  • 实验操作规范
    1. 核心引物对必须使用标准附录A规定的引物序列
    2. PCR扩增退火温度偏差控制在±1℃以内
    3. 电泳检测分辨率需达到1bp差异识别能力
  • 核验判定准则
    1. 品种同一性判定需满足全部核心位点等位基因完全匹配
    2. PIC值低于0.5的位点应增加辅助位点检测
    3. 争议样本需补充标准附录B推荐的18个扩展位点进行复验
标准解读不等同于原文,以标准原文为准

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