基于高通量测序的环境微生物检测 第2部分:人粪便微生物宏基因组检测方法

Detection of environmental microorganisms based on high-throughput sequencing

T/SZGIA 2-2016科学研究和技术服务业

现行

更新日期:2026-09-12

标准状态

发布日期

2017-01-20

实施日期

2017-01-21

基础信息

标准号

T/SZGIA 2-2016

团体名称

深圳市生命科技产学研资联盟

包含专利

否

标准分类

国际标准分类号

07.100.01 微生物学综合

行业分类

M731 自然科学研究和试验发展

标准层级

团体标准

适用范围

本部分为《基于高通量测序的环境微生物检测》第2部分,规定了采用高通量测序技术进行人粪便微生物宏基因组检测的方法,包括样品的采集、保存,实验室工作程序,样品处理程序及质量控制、测序数据质量控制。本部分适用于利用宏基因组学方法进行人粪便微生物检测。

主要技术内容

本标准规定了检测对象、检测要求、样品采集、保存与运输的要求;检测步骤包括实验室必须要满足的条件;以及DNA的质量判定标准;文库构建以及高通量测序流程;数据信息分析和数据质量控制的要求。其中数据质量控制规定了质量要求和数量要求,质量要求测序完成后,每个DNA样品对应的有效可用数据质量值应符合如下要求:Q20≥90%,该样品测序结果90%以上的碱基质量值大于20;Q30≥80%,该样品测序结果80%以上的碱基质量值大于30。而数量要求:为了完成后续物种注释,功能分析等数据分析步骤,要求每个样品测序短序列数目(

起草单位

深圳华大基因研究院、蓝色彩虹(深圳)科技有限公司、深圳华大基因科技有限公司、南方医科大学、深圳龙岗区妇幼保健院、深圳市谱元基因研究院、深圳弘睿康生物科技有限公司、深圳市微健康基因研究院、华大精准营养(深圳)科技有限公司、深圳市恒创基因科技有限公司、上海凡迪生物科技有限公司

起草人

陈冰、李俊桦、蒋慧、罗佳波、谭晓梅、范钦、罗兰、魏凤香、刘靓、李陶莎、谢强、杜佳婷、李倩一、李岱怡、覃俊杰、胡鹏、马振华、戴文魁、李骏、陈蕾。

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