主要技术内容
本文件规定了低深度全基因组重测序中的下机数据质控、基因型推断技术和遗传变异解读结果的要求。本文件适用于人类、动物和植物等一系列已建立国际通用标准参考基因组的物种,且全基因组重测序平均深度低于10X的基因组数据分析,对个体进行基因型推断和遗传变异解读。本文件不适用于临床诊断的基因数据分析。
General requirements of genotype imputation and variation interpretation in lowpass whole genome resequencing
现行
2021-11-23
2021-11-30
T/LTIA 14-2021
深圳市生命科技产学研资联盟
否
07.080
Q849 其他卫生活动
团体标准
本文件规定了低深度全基因组重测序中的下机数据质控、基因型推断技术和遗传变异解读结果的要求。 本文件适用于人类、动物和植物等一系列已建立国际通用标准参考基因组的物种,且全基因组重测序平均深度低于10X的基因组数据分析,对个体进行基因型推断和遗传变异解读。 本文件不适用于临床诊断的基因数据分析。
本文件规定了低深度全基因组重测序中的下机数据质控、基因型推断技术和遗传变异解读结果的要求。本文件适用于人类、动物和植物等一系列已建立国际通用标准参考基因组的物种,且全基因组重测序平均深度低于10X的基因组数据分析,对个体进行基因型推断和遗传变异解读。本文件不适用于临床诊断的基因数据分析。
深圳华大生命科学研究院、深圳市早知道科技有限公司、深圳华大智造科技股份有限公司、深圳瑞奥康晨生物科技有限公司、深圳市生命科技产学研资联盟、深圳华大基因科技服务有限公司、北京知因新生活细胞生物科技有限公司、青岛华大智造科技有限责任公司、深圳华大基因科技有限公司
翦敏、陈奕、吴静静、黄飞、张勇、李胜康、黄志博、黎宇翔、陈钢、杨旭、吴莉萍、王理中、陶勇、张艳艳、苟洪兰、唐森威、李延红、李陶莎、罗宏敏、梁鑫明、赵霞、滕飞、徐驰、张和、刘姗姗、武庆超、吴昊、李倩一、骆顺
| 标准号 | 标准名称 | 状态 | 发布日期 | 实施日期 |
|---|---|---|---|---|
| T/LTIA 15-2021 | 人类基因组的低深度全基因组重测序的基因型推断和遗传变异解读 | 现行 | 2021-11-23 | 2021-11-30 |
| T/SZAS 22-2020 | 基于全基因组测序的益生菌菌株分型鉴定指南 | 现行 | 2020-11-04 | 2020-12-05 |
| T/SZGIA 7-2019 | 基因组从头组装质量指南 | 现行 | 2019-06-25 | 2019-06-30 |
| T/SZGIA 7-2019 | 基因组从头组装质量指南 | 现行 | 2019-06-25 | 2019-06-30 |
| T/SZAS 22-2020 | 基于全基因组测序的益生菌菌株分型鉴定指南 | 现行 | 2020-11-04 | 2020-12-05 |
| T/GDPMAA 0004-2020 | 基于孕妇外周血浆游离DNA高通量测序无创产前筛查胎儿基因组病技术标准 | 现行 | 2020-11-28 | 2020-11-28 |
| GB/T 43279.2-2023 | 分子体外诊断检验 静脉全血检验前过程的规范 第2部分:分离基因组DNA | 现行 | 2023-11-27 | 2024-06-01 |
| DB15/T 4470-2026 | 奶山羊基因组选择育种技术规程 | 现行 | 2026-07-10 | 2026-08-10 |
| T/GDPMAA 0004-2020 | 基于孕妇外周血浆游离DNA高通量测序无创产前筛查胎儿基因组病技术标准 | 现行 | 2020-11-28 | 2020-11-28 |
| GB/T 46660-2025 | 新型冠状病毒全基因组测序通用技术要求 | 即将实施 | 2025-10-31 | 2026-11-01 |
| DB6523/T 408-2024 | 羊基因组选择育种技术规程 | 现行 | 2024-12-10 | 2024-12-30 |
| GB/T 46433.1-2025 | 生物技术 基因组编辑 第1部分:术语 | 即将实施 | 2025-10-05 | 2026-05-01 |
| DB43/T 3044-2024 | 猪基因组选择育种技术规程 | 现行 | 2024-08-30 | 2024-11-30 |
| GB/T 40419-2021 | 健康信息学 基因组序列变异置标语言(GSVML) | 现行 | 2021-10-11 | 2022-05-01 |
| DB65/T 4641-2022 | 胡杨和灰杨基因组DNA保存技术规程 | 现行 | 2023-04-18 | 2023-06-20 |
| GB/T 30988-2014 | 多酚类植物基因组DNA提取纯化及测试方法 | 现行 | 2014-07-24 | 2015-03-01 |
| GB/T 25170-2010 | 畜禽基因组BAC文库构建与保存技术规程 | 现行 | 2010-09-26 | 2011-03-01 |
| DB43/T 3045-2024 | 地方猪品种纯度基因组鉴定技术规程 | 现行 | 2024-08-30 | 2024-11-30 |
| GB/T 45137-2024 | 畜禽基因组编辑育种技术规程 | 现行 | 2024-12-31 | 2024-12-31 |
| GB/T 40184-2021 | 畜禽基因组选择育种技术规程 | 现行 | 2021-05-21 | 2021-12-01 |
| T/SHSA 009-2021 | 居家和社区养老服务中心基础建设标准 | 现行 | 2021-11-29 | 2021-11-29 |